Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm340F6RGI3 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm340F6RGI3 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms