Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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