Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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