Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Atg3Q9CPX6 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Atg3Q9CPX6 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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