Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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Trim12aQ99PQ1 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim12aQ99PQ1 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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