Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm9955Q8CEJ8 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms