Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms