Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Snx17Q8BVL3 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.6 ms