Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms