Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms