Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
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