Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Hoxd13P70217 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Hoxd13P70217 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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