Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms