Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Epb42P49222 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms