Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
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