Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms