Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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