Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TP20293 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TP20293 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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