Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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H2-Eb1P04230 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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H2-Eb1P04230 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-Eb1P04230 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-Eb1P04230 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-Eb1P04230 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-Eb1P04230 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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H2-Eb1P04230 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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