Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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PtprbB2RU80 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PtprbB2RU80 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PtprbB2RU80 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PtprbB2RU80 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PtprbB2RU80 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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PtprbB2RU80 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprbB2RU80 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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