Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Scn3aA2ASI5 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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