Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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