Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms