Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Top1mtQ8R4U6 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Top1mtQ8R4U6 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Top1mtQ8R4U6 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Top1mtQ8R4U6 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Top1mtQ8R4U6 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Top1mtQ8R4U6 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Top1mtQ8R4U6 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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