Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Snx17Q8BVL3 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms