Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ttc29Q80VM3 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ttc29Q80VM3 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms