Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Ccdc18Q640L5 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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