Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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