Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms