Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TrioQ0KL02 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms