Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd13P70217 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd13P70217 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd13P70217 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd13P70217 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd13P70217 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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