Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Sh3bp1P55194 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Sh3bp1P55194 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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Sh3bp1P55194 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Sh3bp1P55194 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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