Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxa10P31310 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms