Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms