Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Hoxd9P28357 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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