Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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