Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sptan1P16546 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms