Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms