Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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