Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Spocd1B1ASB6 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Spocd1B1ASB6 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Spocd1B1ASB6 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Spocd1B1ASB6 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Spocd1B1ASB6 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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