Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms