Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Itgb2l-202ENSMUST00000113773 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm13110-201ENSMUST00000138077 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tmem19-209ENSMUST00000219890 2949 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms