Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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