Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.3 ms