Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms