Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms