Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms