Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Pkp1P97350 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Pkp1P97350 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Pkp1P97350 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Pkp1P97350 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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