Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
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