Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
RxraP28700 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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